Η ιογενής γαστρεντερίτιδα είναι μια συνηθισμένη λοίμωξης στα παιδιά. Οι οδηγίες για να την αποφύγετε είναι οι ίδιες με τις οδηγίες για την πρόληψη άλλων ιογενών νοσημάτων, δηλαδή συχνό πλύσιμο των χεριών και αποφυγή αγγίγματος των βλεννογόνων (μάτια, μύτη, στόμα).